为立足我市产业创新发展需求，聚焦区域创新合作体系建设，整合优质科技创新服务资源，促进区间科技合作和成果转移转化，南京市出台了《促进长三角（南京都市圈）科技合作实施办法》，中心受科技局委托，承担了该项目的推进落实等全流程工作。
　　一是挖掘高质量服务机构，从源头定位项目运行水准。通过多渠道挖掘筛选，遴选出一批具有对外服务能力、专注于科技成果转移转化的优质中小型服务机构，建立机构储备库，充实项目储备资源，为项目高质量开展打下坚实基础。
　　二是规范项目管理流程，从制度保障项目运行质量。建立项目申报、运营、结题及绩效考评全流程管理规范，涉及环节流程、工作内容、职责划分、管理要求等内容，包括机构提交月度总结、管理部门参与日常走访调研及活动，强化规范意识，明确责任主体，保证项目科学化、系统化扎实推进。
　　三是强化问题调研分析，从手段提升项目运行成效。总结完善上年度项目执行中发现的问题和不足，编制责任任务清单，明确各机构项目执行重点任务；引导机构对都市圈内企业开展精准服务对接，在走访调研、摸排成果需求的基础上，充分了解企业面临的难点、痛点，以需求为导向，开展各类针对性活动，解决企业在经营过程中存在的各种问题。
　　四是加强资源统筹协调，赋能科技服务机构高质量发展。梳理我市科研院所、高校、科技公共服务平台、工程技术中心等科技创新平台主要成果、人才团队、服务方向等方面的信息，向机构进行推送，并做好对接协调，进一步提升机构服务能力；根据需求，协助机构对接都市圈各城市科技主管部门，充分利用我市丰富科创资源辐射带动都市圈科创发展，扩大机构服务范围。
　　三年来，项目共支持29家机构参与项目实施，通过走访调研、牵头组织技术攻关联盟，或举办各类技术对接会、项目融资会、培训会等形式，调研企业超两千家，征集各类需求近千条，举办各类活动150余场，辐射上海、安徽、浙江等长三角地区十几个城市，达成合作意向150多项，完成技术合同登记近1.5亿元，帮助企业融资近3亿元。